X-UIDL: 3cb728fa0000153e
X-Mozilla-Status: 0001
X-Mozilla-Status2: 00000000
Return-Path: <porazil@mbox.vol.cz>
Received: from smtp2.vol.cz (smtp2.vol.cz [195.250.128.42])
	by tao.natur.cuni.cz (a.b.c/a.b.c) with ESMTP id gBJGtNrg327700
	for <jindrich@natur.cuni.cz>; Thu, 19 Dec 2002 17:55:23 +0100 (MET)
X-Obalka-From: porazil@mbox.vol.cz
X-Obalka-To: <jindrich@natur.cuni.cz>
Received: from mbox.vol.cz (prahag-176.dialup.vol.cz [62.177.103.176])
	by smtp2.vol.cz (8.12.6/8.12.6) with ESMTP id gBJGtLkR094320;
	Thu, 19 Dec 2002 17:55:21 +0100 (CET)
	(envelope-from porazil@mbox.vol.cz)
Sender: petr@smtp2.vol.cz
Message-ID: <3E0206C8.5BB18244@mbox.vol.cz>
Date: Thu, 19 Dec 2002 18:50:00 +0100
From: Petr Porazil <porazil@mbox.vol.cz>
X-Mailer: Mozilla 4.77 [en] (X11; U; Linux 2.4.19 i686)
X-Accept-Language: en
MIME-Version: 1.0
To: jindrich@natur.cuni.cz
CC: pisa@cmp.felk.cvut.cz
Subject: Pripominky k CHROMuLANU
Content-Type: text/plain; charset=us-ascii
Content-Transfer-Encoding: 7bit
Status:   

Dobry den

posilam Vam seznam pripominek k chromulanu, nektere se opakuji z
drivejska

Chyby :

+- bezi-li sekvence, ignoruje nacitani na radce specifikovaneho templatu
  melo by to chodit tak, ze nejvyssi prioritu ma primo definovana
  metoda a program, nizsi definovany templat na radce a nejnizsi
  templat definovany pri zakladani analyzy

+- nacitani programu a metody podle zadani na radce sice chodi,
  ale hleda se ve spatnem adresari ( pri zadani se jmeno zkrati,
  ale pri behu se ignoruje v procesoru nastaveni z directories) ulitype

Chyby ktere nebyly ve verzi 0.60, ale objevily se v dalsich verzich :

- neco se pokazilo ve hledani kanalu a spousteni programu (data jdou).
  Pri aktivate processing to hlasi Channel not found. Pri prepare to
  nedela nic.Nechodi spravne Wait for Mark

+- pri preruseni behu manualni analyzy a zavirani okna se vyhlasi chyba
  integer overflow.

Dalsi pozadavky :

+- provoz z analyzatorem pri chybe davkovani zapsat do logu a do
   protokolu vzorku cislo chyby z autosampleru

- dodelat kalibrace podle nasledujicich jiz jednou dodanych pripominek

   - Bylo by vyhodnejsi, kdyby ULC soubor obsahoval pouze specielni
     datovou vetev s kalibraci (na urovni Method, Program, ...), nikoliv

     cely ULF strom, protoze prumerny cas peaku a dalsi podobne hodnoty
     nemaji smysl.

   - Novy radek pro ulozeni peaku v kalibraci by mel zatim nest pouze jmeno
     a prumerny response (v budoucnosti i vicebodove kalibrace atd,
     nebo se pro jine druhy kalibraci definuji nove radky)

   - dale by mel soubor obsahovat seznam souboru a zpusob jakym byl vytvoren

   - protoze by nezacinal soubor ULF korenem, mel by se po otevreni zobrazit
     jednoduseji, asi podobne jako Setup vzorku, s moznosti prochazet seznam
     pouzitych souboru, kalibracnich radek pro peaky a vyvolanim prepocitani.
     (tento nazor se Ti urcite moc nelibi, ale soucasne reseni je prilis
     neprehledne a zaroven uklada do souboru prilis mnoho neuzitecnych
     i matoucich dat)

   - problem s vyhodnocenim proti kalibracnimu souboru je ten, ze ve vypoctu
     dane analyzy se nacte prirazena kalibrace, ale z kalibrace se nevezmou
     responses - misto toho se znovu napocitaji z plochy a deklarovane hodnoty
     u peaku standardu. To je vyhodne pro klasicke zaznamy. Pri pouziti
     ULC by se ovsem by se mely prave vzit ty prumerne responses a nenahrazovat
     je hodnotami z jednoho z vlozenych vzorku.

- do okna chromatografu dat dolu misto prepinacu View talcitka s
  nasledujicimi funkcemi:

   +- Nacteni metody (Method->Load From) Dialog by se mel nastavit na adresar
     Method
   +- Ulozeni metody (Method->Save To)
   +- Prirazeni kalibracniho standardu (Method->Load Calibration File)
     Dialog by se mel nastavit na stejny adresar ve kterem je ulozena
     editovana analyza.
   +- Autodetekt (Peaks->Autodetect)
   +- Zobrazeni vysledku (Peaks->Browse)
   +- Tisk vysledku (Print->Report)

  U tlacitek pro metodu a standard by bylo vhodne zobrazit aktualni
  soubor

- pri provozu z chromatografem zajistit hlidani nastavenych parametru,
  nejlepe umoznit v programu periodicky spoustet skript. Pokud skript
  vydetekuje chybu, mel by mit moznost zastavit prave bezici program a
  spustit jiny program.

- pridat do skriptu funkci pipnuti a vypsani textu na obrazovku.

- zaridit aby v programu fungovaly radky Seq.PrgLine i pri spusteni
  jednotlive analyzy (bez seqence).

- skenovani, moznost do programu vlozit prikaz, ktery zastavi prutok a
  proskenuje spektrum v zadanych mezich. Naskenovane data je potreba nejak
  zobrazit asi ve zvlastnim okne.

+- pro provoz analyzatoru je potreba vylepsit popis chyby
  ukladany do pruvodky vzorku v sekvenci.
  Jedna se predevsim o ulozeni kodu stavu autosampleru
  po vyhodnoceni chyby.

Dalsi poznamky - vetsinou uz jednou reportovane

Neprijemna drobnost je, ze kdyz se ciste nainstaluje
pro predvedeni na pocitac bez driveru a bez
naplneneho ULD.ULD, tak se dost bouri
ze nemuze najit uLanDefaultChannel.
Napriklad pri editaci programovych radek,
pri vstupu do okenka New ... .
Hodilo by se, kdyby se ChromuLan dokazal
bez kanalu obejit pro jiz namerena data.
Propojeni i pro nove otviranou analyzu by
idealne melo byt provedeno az po nastaveni
kanalu a potvrzeni uvodniho dialogu.
Umoznilo by to napriklad bez potizi spoustet
shodny templat na prvnim volnem z nekolika kanalu.

Chromulan necha zapsat do sekvence dva soubory pod
stejnym jmenem a neupozorni na to.


Preji hezke vanoce

Petr Porazil

